تقنية

أجرى المقابلة: جيمس فليمنج، مدير تكنولوجيا المعلومات، معهد فرانسيس كريك


كل الزعيم الرقمي يحب أن يعتقد أن عملهم يساعد في تعزيز قضية أعظم. بالنسبة لجيمس فليمنج، مدير تكنولوجيا المعلومات في معهد فرانسيس كريك، فإن عنصر القيمة المضافة هو عنصر أساسي في وظيفته.

“أذهب إلى النوم ليلاً معتقدًا أنني كذلك المساعدة في علاج السرطان باستخدام أجهزة الكمبيوتر“، يقول وهو يفكر في أدواره ومسؤولياته اليومية. وانضم فليمنج إلى فريق كريك في أكتوبر 2018، بعد أن أمضى حياته العملية منذ تخرجه مع شركة الاتصالات العملاقة بي تي. خلال السنوات الـ 11 التي قضاها في BT، عمل في مشاريع كبرى كمصمم ومدير فني.

“لقد كان أساسًا رائعًا لفهم التكنولوجيا. كان دوري الأخير في شركة BT هو منصب المدير الفني لبرنامج نشر النطاق العريض للألياف في المملكة المتحدة، والذي كان بمثابة مبادرة ضخمة وتعرضت لضغوط شديدة. يقول فليمنج: “في نهاية هذا المشروع، كنت مستعدًا لشيء جديد”.

“اتصل بي أحد مسؤولي التوظيف وقال: “هل أنت مهتم بالعمل في معهد الأبحاث الضخم هذا في لندن؟” كنت أسير بالقرب من فندق كريك يوميًا وأفكر: “قد يكون هذا مكانًا مثيرًا للعمل”. ولقد اكتشفت أنه مكان مثير للاهتمام للغاية للعمل فيه.”

يجد فليمنج أن الدور يمثل تحديًا ومرضيًا ومثيرًا. يستخدم أكثر من 2000 موظف وطالب في Crick معارفهم وخبراتهم واسعة النطاق للعمل عبر التخصصات واستكشاف علم الأحياء على جميع المستويات، من الجزيئات إلى الخلايا إلى الكائنات الحية بأكملها.

“نحن ننظر إلى كل جانب يمكنك تصوره من الأمراض التي تصيب الإنسان. لا يقتصر الأمر على السرطان فحسب، على الرغم من أن هذا يمثل ركيزة كبيرة لما نقوم به لأننا نتلقى تمويلًا ثالثًا أبحاث السرطان في المملكة المتحدة. ويقول: “إننا ننظر إلى كل العوامل البيولوجية الأساسية لفهم الأمراض التي تصيب الإنسان”.

“إنه حرفيًا المكان الذي يمكن لأي شخص أن يكون لديه فكرة يمكن أن تحدث تأثيرًا يغير العالم. انها مثيرة. ولكن هذا يعني أيضًا أن المتطلبات التي يتعين عليك محاولة مواكبتها هائلة. هذا التحدي المتمثل في الدور هو ما يجعله مثيرًا.

دعم التغيير التحويلي

بدأ مركز كريك العمل في منشأته الجديدة المخصصة لهذا الغرض بالقرب من محطة كينغز كروس في لندن في أوائل عام 2017. واليوم، يضم المركز أكثر من 100 مجموعة بحثية. يقول فليمنج، الذي يرفع تقاريره إلى مدير البنية التحتية للأبحاث في المعهد، إن الكثير من العمل خلال السنوات الست التي قضاها في المعهد كان يركز على المساعدة في إنشاء البنية التحتية للمعهد.

يقول: “كانت تلك المرحلة الأولى محمومة”. “لم يكن الأمر مجرد تحول مؤسسي لأنه لم يكن هناك الكثير مما يمكن تحويله. كان الأمر يتعلق ببناء كل شيء من الصفر. لقد كنا في وضع بدء التشغيل خلال العامين الأولين.”

أذهب للنوم ليلًا معتقدًا أنني أساعد في علاج السرطان باستخدام أجهزة الكمبيوتر

جيمس فليمنج، معهد فرانسيس كريك

ظهرت تحديات أخرى في عام 2020 عندما تحولت عملية بدء تشغيل البنية التحتية بسرعة إلى جائحة فيروس كورونا. أعاد فليمنج وزملاؤه توظيف المعهد بأكمله ليكون بمثابة خط أنابيب لاختبار فيروس كورونا لصناديق الاستثمار الحادة في لندن. قامت المنظمة باختبار الموظفين والمرضى خلال تلك الفترة. ويصف وتيرة جهود التحول بأنها محمومة.

يقول: “لقد تمكنا من تشغيل خط الأنابيب في تسعة أيام”. “قمنا بعد ذلك ببناء حل لاختبار الموظفين فوق خط الأنابيب هذا في تسعة أيام أخرى قمنا أيضًا بتمديدها إلى Wellcome Trust و الحرم الجامعي سانجر جينوم في كينغستون، وهو أمر حيوي لأنهم كانوا ينسقون جميع تحليلات المتغيرات الجينية للبلاد. لقد أبقى عملنا هذه العمليات مفتوحة حتى يتمكنوا من متابعة وتتبع المتغيرات المختلفة.

يعكس فليمنج هذه الفترة المضطربة من التغيير من خلال الإشارة إلى أنه لم يكن هناك وقت لالتقاط الأنفاس. واصل The Crick تجنيد الباحثين وتوسيع نطاق أنشطته العلمية. لقد تضاعف حجم المنظمة تقريبًا منذ عام 2017. ويقول فليمنج إن الزيادة في الحجم كانت مصحوبة بـ “ثورة كاملة” في كيفية أداء العلوم.

“كانت بذور التغيير موجودة منذ ست سنوات عندما انضممت، وكان كريك يفكر بشكل تقدمي في منهجه تجاه علم البيانات. استثمر المعهد بكثافة في الجيل الأول من الحوسبة عالية الأداء. لقد انتقلنا للتو إلى الجيل الثاني الآن، بعد استثمار كبير في التحديث.

“من العدل أن نقول إن أساليب علم البيانات قد انتقلت من كونها نشاطًا صغيرًا ومتخصصًا في مجال المعلوماتية الحيوية إلى كونها الآن جزءًا من مجموعة الأدوات القياسية لكل مختبر في المبنى. لذلك، كانت هناك هذه الثورة في تلك الفترة بين بيولوجيا المختبر الرطب والبيولوجيا الحاسوبية التي كان علينا مواكبتها والمساعدة في تمكينها أيضًا.

إنشاء منصة مرنة

انضم Fleming إلى Crick كمدير لتكنولوجيا المعلومات. ويقول إن أحد التغييرات الرئيسية خلال الفترة التي قضاها في المعهد كان عندما تم جمع الحوسبة العلمية مع بقية قسم تكنولوجيا المعلومات. أدت عملية التكامل هذه إلى إنشاء دور مدير تكنولوجيا المعلومات في عام 2021.

ومن خلال دوره في الإشراف على التكنولوجيا، يعمل فليمنج مع العديد من موفري الأجهزة والبرامج. توفر Nvidia وحدات معالجة الرسومات (GPUs)توفر Dell وحدات المعالجة المركزية (CPUs)، وتوفر Lenovo وIBM وحدات تخزين. يقوم Crick أيضًا بتشغيل حزمة برامج مفتوحة المصدر أعلى أجهزته.

Snowflake هو مزود رئيسي آخر. في عام 2022، فليمنج وأوضح لمجلة الكمبيوتر الأسبوعية كيف توفر سحابة البيانات الخاصة بالمورد عناصر تحكم دقيقة في الوصول وإعداد التقارير الإدارية والمصادقة والتحكم في الفواتير وإمكانات مشاركة البيانات. استخدم المعهد Snowflake للبناء بيئات البحث الموثوقة (TREs)، والتي تدعم الأبحاث الرائدة في مختلف المجالات. يقول فليمنج إن هذا الجهد مستمر في التوسع.

“كان The Crick ذو تفكير تقدمي تمامًا في منهجه تجاه علم البيانات. استثمر المعهد بكثافة في الجيل الأول من الحوسبة عالية الأداء. لقد انتقلنا للتو إلى الجيل الثاني الآن، بعد استثمار تحديث كبير”

جيمس فليمنج، معهد فرانسيس كريك

ويقول: “نحن نستخدم Snowflake كمساعد لجميع أبحاث الحوسبة عالية الأداء التي نجريها”. تضمن المنصة بقاء البيانات المحددة سريريًا آمنة. تدعم TREs مشاريع متعددة، بدءًا من المشروع التجريبي الأصلي للمعهد لـ Snowflake، والذي نظر في تأثير فيروس كوفيد الطويل على السرطانات النادرة، إلى التحقيقات في وبائيات فيروس كورونا. يقول فليمنج ندفة الثلج يساعد في عمليات البحث بين الإدارات.

ويقول: “هذا حل أنيق لمشكلة “كيف يمكنني العمل مع مجموعة البيانات الخاصة بي؟”، والتي تتكون من شرائح مجمعة من مجموعات بيانات متعددة الأشخاص”. “لكن الجميع مطمئنون. أنت لا تقوم برمي البيانات بعيدًا في الخوادم، ولن يتم رؤيتها مرة أخرى أبدًا.

واليوم، تدعم التكنولوجيا عشرات المشاريع المتزامنة مع TREs مختلفة. يصف فليمنج Snowflake بأنها منصة “العمل كالمعتاد” للأبحاث السريرية. ويقول إن المرحلة التالية ستنظر في كيفية دعم التكنولوجيا لمجالات جديدة.

يقول: “إن TREs هي في الواقع مجرد تكوين لـ Snowflake”. “إن المرونة التي يوفرها لك هذا النهج عندما تتمكن من التعامل مع بنية المكونات الأساسية للمنصة تعني أنه يمكنك القيام بالكثير والكثير من الأشياء الرائعة جدًا.”

استكشاف مجالات جديدة

يدرك فليمنج أن التحديات التي واجهها خلال العامين الماضيين قد اشتدت مع الوتيرة السريعة للتطور التكنولوجي. لقد أصبحت صناعة تكنولوجيا المعلومات وعامة الناس متحمسين لـ إمكانات الذكاء الاصطناعي التوليدي (GenAI).

وقد استخدم المعهد منذ فترة طويلة التقنيات الناشئة، مثل الذكاء الاصطناعي والتعلم الآلي، لمساعدة الباحثين على فتح الاكتشافات. ومع ذلك، يقول فليمنج إن الفرصة المتزايدة لاستخدام GenAI لم تؤد إلى تحول كبير في العمل في Crick.

تعتبر القابلية للإثبات عنصرًا أساسيًا في عملية البحث العلمي. ويقول إن الباحثين لا يمكنهم ببساطة استخدام نماذج اللغة الكبيرة المتاحة للجمهور للإجابة على الأسئلة الكبيرة في الحياة: “يجب أن تكون صارمًا فيما يتعلق بمصدر ما تعمل به، والبيانات التي تستخدمها، وكيف قمت بتحسينها”. أداء النموذج مع مرور الوقت، وما فعله هذا التحليل لفهمك الآلي للمرض، وما إلى ذلك.

إن مفتاح البحث العلمي الناجح هو استخدام تقنيات مجربة وموثوقة لتقديم نتائج تم اختبارها بدقة وإثباتها. وبدلاً من القفز على عربة GenAI، يقول فليمنج إن التحدي الكبير التالي سيكون استخدام التكنولوجيا لمساعدة الباحثين على ضمان أن يكون البشر في قلب التحليلات العلمية. يعطي مثالا.

ويقول: “قام أحد قادة مجموعتنا بعمل بارز نُشر في الخريف الماضي، والذي أنشأ آلية جديدة لتطور سرطان الرئة المرتبط بملوثات الهواء”. “السؤال الواضح الذي يريدون استكشافه هو: حسنًا، لقد قمنا الآن بهذا الارتباط على مستوى المختبر المحلي، فماذا يعني ذلك على مستوى السكان؟”

يقول فليمنج إن باحثين آخرين يدرسون تأثير المواد البلاستيكية الدقيقة الموجودة في البيئة على التنكس العصبي. يتطلب استكشاف هذه الأسئلة البحثية أنواعًا جديدة من البيانات في مجموعات جديدة.

يقول: “أنت بحاجة إلى العمل جغرافيًا مكانيًا”. “أنت بحاجة إلى العمل مع مصادر البيانات البيئية. إذًا، كيف يمكننا جلب تلك البيانات وربطها بالمختبر السريري؟”

الجواب، كما يقترح فليمنج، هو أن يتوصل فريقه إلى كيفية استخدام المعهد لمصادر البيانات غير التقليدية التي تعتبر عادةً جزءًا من العلوم البيئية بدلاً من عالم علوم الحياة.

“كيف يمكنك ربط هذه العوالم بالمنصات، ربما باستخدام تقنيات مثل إنترنت الأشياء وأجهزة الاستشعار وأدوات رسم خرائط البيانات الجغرافية المكانية، إلى كل شيء بدءًا من الأرض كنظام بيئي إلى تصوير بروتين فردي؟ لا أعرف كيف سنحل هذا السؤال بعد، ولكن ربما يكون هذا هو السؤال التالي الذي لم تتم الإجابة عليه والذي نحتاج إلى معالجته.

تقديم حلول رائدة

يقول فليمنج إن المنظمة الرقمية التي يرغب في إنشائها خلال 24 شهرًا ستظل وفية للمبادئ طويلة المدى التي حكمت عمله كرئيس قسم تكنولوجيا المعلومات في Crick. ويقول: “عندما قمنا بتجميع استراتيجية القسم، قال بيان المهمة إننا نريد تمكين العلوم ذات المستوى العالمي – ولا يزال هذا هو الحال”.

يقول فليمنج إن العلماء من جميع أنحاء المنظمة يأتون إلى قسمه بشكل متزايد ومعهم مشكلات تحتاج إلى حل. يستطيع فريقه مساعدة هؤلاء الخبراء إذا قاموا ببناء أسس قوية للأجهزة والبرامج. ويرى فليمنج أن الأسس هي بمثابة قناة تنقل العلماء من الفرضيات إلى الحلول.

“لن يتمكنوا من الإجابة على الأسئلة التي يريدون الإجابة عليها إلا عندما نبني الجسر من مكان إلى آخر. ويقول: “في جميع أنحاء المنظمة ككل، آمل أن نكون قد قمنا ببناء هذا الهيكل بالفعل – وآمل أن نستمر في صقل نهجنا”.

“نحن بحاجة إلى توفير مؤسسة تكنولوجيا معلومات ديناميكية وموجهة نحو حل المشكلات، مع خبرة تقنية عميقة لإعادة تشكيل حلول قابلة للتطوير وعالية الجودة ومتخصصة تمامًا في المقام الأول، ولكن بعد ذلك من المحتمل أن تكون قابلة للتطبيق بشكل عام، وبسرعة كبيرة جدًا. “



Source link

زر الذهاب إلى الأعلى